Balai Padukuhan Klajuran merupakan bangunan dengan arsitektur tradisional Jawa yang ditandai oleh bentuk atap limasan dan kampung. Bangunan ini terdiri dari pendhapa, nDalem, dan gandhok, serta menghadap ke selatan. Pendhapa memiliki denah persegi panjang dan merupakan bangunan terbuka dengan atap limasan srotong yang terbuat dari genteng vlam dan rangkaian bambu yang diikat dengan ijuk. Atap tersebut ditopang oleh 16 tiang kayu, termasuk 8 tiang utama dan 8 tiang emper, yang berdiri di atas umpak batu. Di belakang pendhapa terdapat pringgitan yang menyambung dengan nDalem, yang memiliki denah persegi panjang dan atap limasan srotong dengan atap emper di sebelah timur. Atap nDalem terbuat dari genteng vlam, dindingnya dari bata, dan disangga oleh empat tiang di bagian tengah. nDalem memiliki pintu masuk di bagian tengah serta pintu yang menghubungkan dengan gandhok, dan dilengkapi dengan senthong yang terdiri dari senthong tengen, senthong tengah, dan senthong kiwo. Di sebelah timur nDalem terdapat gandhok dengan denah persegi panjang, atap kampung srothong yang ditutup genteng vlam, dan didukung oleh dua tiang kayu. Gandhok memiliki dua kamar dan empat pintu—utara dan selatan untuk keluar, barat menuju nDalem, dan timur menuju dapur. Sebelah timur gandhok terdapat pawon (dapur) dengan denah persegi panjang, atap kampung srothong, penutup genteng vlam, dan dinding bata, serta tiga pintu—barat ke gandhok, selatan dan timur sebagai pintu keluar. Meskipun mengalami penggantian lantai menjadi keramik krem ukuran 30 cm x 30 cm pada pendhapa dan nDalem, bangunan ini masih memiliki tingkat keaslian lebih dari 80%. Penambahan bangunan baru berupa aula juga dilakukan di sebelah timur pendhapa untuk keperluan warga.